Većina rijeka Hondurasa je planinska. Otvara se lista najvećih rijeka u cijeloj republici - Patuka, Ulua i Aguan.
Aguan River
Rijeka prolazi teritorijima sjevernog Hondurasa, počevši od departmana Yoro. Zatim odlazi na putovanje, birajući istočni smjer, prelazeći zemlje departmana Colon. A putovanje završava ulijevanjem u vode Karipskog mora (u blizini Santa Rosa de Aguán). Ukupna dužina struje doseže gotovo četiri stotine kilometara. Aguana ima nekoliko pritoka.
Dolina rijeke aktivno se koristi u poljoprivredi. U dolini u gornjem / srednjem dijelu potoka nalaze se njive povrća, kao i plantaže kukuruza i pasulja. Dolina donjeg toka prepuštena je riži i agrumima. Ovdje se uzgajaju i uljna palma i platan.
Rijeka Riu-Sumpul
Rio Sumpul probija se kroz zemlje dvije države odjednom - El Salvador (njegov sjeverozapadni dio) i Honduras (jugozapadne teritorije). Rijeka je vrlo kratka - samo sedamdeset sedam kilometara - i cijelom svojom dužinom služi kao granica koja dijeli teritorije ovih država.
Izvor Rio Simpul nalazi se u El Salvadoru. Tamo rijeka prelazi nekoliko općina (sve se nalaze u jednom odjeljenju - Chalatenango). Ulijeva se u vode Rio Lempa.
Rio Torola
Rio Torola prolazi kroz Srednju Ameriku, protiče kroz zemlje Salvador (sjeveroistočni) i Honduras (južni dio republike). Ukupno trajanje Rio Torole je nešto više od stotinu kilometara. Rijeka nastaje na teritoriji Salvadora na mjestu gdje se rijeka Lahitas spaja s potokom Mansukupagua. Ušće Rio Torole su vode Rio Lempa.
Ulua river
Korijeno rijeke probija teritorij Hondurasa u njegovom sjevernom dijelu, počevši od zemljišta departmana Intibuca (nedaleko od La Paza, padina planina Cordillera de Mentesillos). Ukupna dužina struje je 358 kilometara sa ukupnom slivnom površinom od gotovo dvadeset tri hiljade kvadrata.
Rijeka je nastala spajanjem rijeka Sasagua i Puringla. Uzvodno je poznat kao Rio Grande de Otoro. U početku, rijeka juri prema sjeveru, prelazeći Santa Barbaru u tranzitu, ali nakon toga Ulua naglo skreće na zapad i zaobilazeći tri odjela - Yoro, Cortes i Atlantis - dovršava put u vodama Honduraškog zaljeva.
Goaskoran river
Goaskoran prolazi stazom kroz zemlje Honduras i El Salvador, prelazeći zemlje u južnom dijelu. Dužina struje je oko sto trideset kilometara sa slivom od dvije hiljade šest stotina šezdeset tri kvadratna kilometra.
Posljednjih osamnaest kilometara sadašnje granice prirodna je granica između dvije države. Voda Goaskoran izvor je pitke vode za stanovnike zemlje koji žive na njenim obalama.
