Uobičajeno, rijeke Nepala mogu se podijeliti u tri kategorije (ovisno o vrsti hrane). Prvi su rijeke koje se hrane topljenjem glečera. Druge su rijeke nastale na grebenu Mahabharat. Drugi su različiti potoci i rijeke, čiji je izvor na grebenu Sivalika.
Rijeka Bagmati
Bagmati prolazi kroz zemlje centralnog Nepala i indijsku državu Bihar. Izvor rijeke je u planinama i nastaje ušću nekoliko neimenovanih potoka (oko 15 kilometara od Katmandua).
Vode Bagmati su svete i u hinduizmu i u budizmu. Na obalama rijeke ima mnogo hinduističkih hramova.
Rijeka Barun
Barun prolazi kroz istočne teritorije centralnog Nepala i desna je pritoka rijeke Arun.
Izvor rijeke su glečeri Berun koji se nalaze na planini Makalu. Glavni smjer struje je istok i jugoistok. Rijeka je dio riječnog sistema Kosi, koji uključuje tako velike rijeke kao što su: Arun; Tamur; Sun-Kosi; Indravati; Dudh Kosi; Bhola Kosi.
Rijeka Gandak
Rijeka protiče kroz teritorij Nepala i Indije. Gandak je jedna od četiri najveće nepalske rijeke. Izvor rijeke je u Himalajima, na ušću dvije rijeke: Muztang Khola; Kyugoma Khola. U gornjem toku rijeka se zove Kali-Gandak. Ušće Gandaka su vode rijeke Ganges. Dolina rijeke bila je trgovački put koji je povezivao Indiju i Tibet.
Dolina rijeke Gandak također je zanimljiva jer dijeli Veliki himalajski lanac na dva dijela, prolazeći između dva vrha - Annapura i Daulagiri.
Rijeka Ghaghra
Ghaghra prolazi kroz zemlje tri države - Nepala, Kine i Indije. Ukupna dužina struje je 950 kilometara i ovo je najdublji vodeni tok koji hrani veliki Ganges.
Izvor rijeke nalazi se na teritoriji Tibetanske visoravni (južni dio, područje jezera Manasarovar). Ghaghra je najduža i najveća rijeka u Nepalu. Glavni tip napajanja rijeke: u gornjem toku je voda glečera i otopljenog snijega; donji krajevi se napajaju tokom perioda doji. Rijeka je posebno puna protoka u proljeće i ljeto. U ovo doba godine moguće su velike poplave na Ghaghri. Vode rijeke uglavnom se koriste za navodnjavanje.
Rijeka Dudh-Kosi
Jedna od nepalskih rijeka, koja je jedna od najviših planinskih rijeka ne samo u zemlji, već i u cijelom svijetu. Izvor rijeke je jezero Gokyo. Zatim se struja spušta u trakt Namche-Bazar, gdje se vode Dudh-Kosi spajaju s drugom rijekom-Bhote-Kosi.
Rijeka je savršena za rafting, ali treba imati na umu da ova ruta nije pogodna za početnike.
Rijeka Rapti
Rapti je rijeka u Nepalu i Indiji, ukupne dužine 600 kilometara. Izvor rijeke je na području planina Sivalik.
